MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus uberis 0140J chromosome

Total Repeats: 34027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012004	T	6	6	20	25	0 %	100 %	0 %	0 %	222152202
2	NC_012004	AAAC	2	8	61	68	75 %	0 %	0 %	25 %	222152202
3	NC_012004	T	6	6	79	84	0 %	100 %	0 %	0 %	222152202
4	NC_012004	CAG	2	6	191	196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152202
5	NC_012004	GAT	2	6	244	249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152202
6	NC_012004	GAA	2	6	265	270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152202
7	NC_012004	T	6	6	287	292	0 %	100 %	0 %	0 %	222152202
8	NC_012004	ACAA	2	8	297	304	75 %	0 %	0 %	25 %	222152202
9	NC_012004	TGA	2	6	372	377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152202
10	NC_012004	TTA	2	6	481	486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152202
11	NC_012004	CAG	2	6	545	550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152202
12	NC_012004	A	8	8	663	670	100 %	0 %	0 %	0 %	222152202
13	NC_012004	GAA	2	6	688	693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152202
14	NC_012004	AAT	3	9	721	729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152202
15	NC_012004	AAC	2	6	782	787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152202
16	NC_012004	CTC	2	6	830	835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222152202
17	NC_012004	TTAGT	2	10	974	983	20 %	60 %	20 %	0 %	222152202
18	NC_012004	TGC	2	6	1023	1028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152202
19	NC_012004	GAA	2	6	1084	1089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152202
20	NC_012004	CTCG	2	8	1168	1175	0 %	25 %	25 %	50 %	222152202
21	NC_012004	TGG	2	6	1242	1247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152202
22	NC_012004	TAA	2	6	1278	1283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152202
23	NC_012004	ATTGAG	2	12	1321	1332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152202
24	NC_012004	A	6	6	1338	1343	100 %	0 %	0 %	0 %	222152202
25	NC_012004	CAA	2	6	1604	1609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152203
26	NC_012004	ATT	2	6	1762	1767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152203
27	NC_012004	AAC	2	6	1808	1813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152203
28	NC_012004	AGT	2	6	1818	1823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152203
29	NC_012004	AAG	2	6	1889	1894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152203
30	NC_012004	GCT	2	6	1963	1968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152203
31	NC_012004	ATT	2	6	2073	2078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152203
32	NC_012004	TGT	2	6	2109	2114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152203
33	NC_012004	TTC	2	6	2142	2147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152203
34	NC_012004	GAT	2	6	2158	2163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152203
35	NC_012004	TTTTC	2	10	2180	2189	0 %	80 %	0 %	20 %	222152203
36	NC_012004	TTTC	2	8	2222	2229	0 %	75 %	0 %	25 %	222152203
37	NC_012004	TTA	2	6	2239	2244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152203
38	NC_012004	AGAT	2	8	2265	2272	50 %	25 %	25 %	0 %	222152203
39	NC_012004	GTAAA	2	10	2435	2444	60 %	20 %	20 %	0 %	222152203
40	NC_012004	GAG	2	6	2446	2451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222152203
41	NC_012004	TTG	2	6	2459	2464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152203
42	NC_012004	TGA	3	9	2595	2603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152203
43	NC_012004	AATT	2	8	2618	2625	50 %	50 %	0 %	0 %	222152203
44	NC_012004	TCA	2	6	2715	2720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152204
45	NC_012004	ATC	2	6	2724	2729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152204
46	NC_012004	TAG	2	6	2739	2744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152204
47	NC_012004	A	6	6	2750	2755	100 %	0 %	0 %	0 %	222152204
48	NC_012004	TG	3	6	2765	2770	0 %	50 %	50 %	0 %	222152204
49	NC_012004	A	6	6	2786	2791	100 %	0 %	0 %	0 %	222152204
50	NC_012004	ATG	2	6	2864	2869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152204
51	NC_012004	A	7	7	2897	2903	100 %	0 %	0 %	0 %	222152204
52	NC_012004	TTC	2	6	3064	3069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152205
53	NC_012004	A	6	6	3077	3082	100 %	0 %	0 %	0 %	222152205
54	NC_012004	AAG	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152205
55	NC_012004	AAC	2	6	3106	3111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152205
56	NC_012004	AGTT	2	8	3203	3210	25 %	50 %	25 %	0 %	222152205
57	NC_012004	A	6	6	3230	3235	100 %	0 %	0 %	0 %	222152205
58	NC_012004	GAT	2	6	3252	3257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152205
59	NC_012004	GAA	2	6	3258	3263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152205
60	NC_012004	GAT	2	6	3264	3269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152205
61	NC_012004	ACTT	2	8	3280	3287	25 %	50 %	0 %	25 %	222152205
62	NC_012004	ATA	2	6	3363	3368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152205
63	NC_012004	TGG	2	6	3378	3383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152205
64	NC_012004	T	6	6	3390	3395	0 %	100 %	0 %	0 %	222152205
65	NC_012004	TTA	2	6	3415	3420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152205
66	NC_012004	ATTT	2	8	3433	3440	25 %	75 %	0 %	0 %	222152205
67	NC_012004	TTG	2	6	3543	3548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152206
68	NC_012004	GCT	2	6	3608	3613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152206
69	NC_012004	ATT	2	6	3695	3700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152206
70	NC_012004	A	7	7	3704	3710	100 %	0 %	0 %	0 %	222152206
71	NC_012004	TGA	2	6	3844	3849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152206
72	NC_012004	TGA	2	6	3877	3882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152206
73	NC_012004	TAA	2	6	3955	3960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152206
74	NC_012004	A	6	6	3978	3983	100 %	0 %	0 %	0 %	222152206
75	NC_012004	AAAGAT	2	12	3998	4009	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222152206
76	NC_012004	A	6	6	4035	4040	100 %	0 %	0 %	0 %	222152206
77	NC_012004	AGA	2	6	4054	4059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152206
78	NC_012004	AGA	2	6	4090	4095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152206
79	NC_012004	AAC	2	6	4129	4134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152206
80	NC_012004	TGA	2	6	4186	4191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152206
81	NC_012004	ATTA	2	8	4193	4200	50 %	50 %	0 %	0 %	222152206
82	NC_012004	CAGA	2	8	4226	4233	50 %	0 %	25 %	25 %	222152206
83	NC_012004	AGT	2	6	4243	4248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152206
84	NC_012004	GAA	3	9	4268	4276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152206
85	NC_012004	GAT	2	6	4289	4294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152206
86	NC_012004	TGC	2	6	4360	4365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152206
87	NC_012004	CTG	2	6	4398	4403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152206
88	NC_012004	AAG	2	6	4410	4415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152206
89	NC_012004	CTC	2	6	4449	4454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222152206
90	NC_012004	AGC	2	6	4456	4461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152206
91	NC_012004	ATT	2	6	4466	4471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152206
92	NC_012004	GA	3	6	4484	4489	50 %	0 %	50 %	0 %	222152206
93	NC_012004	GAT	2	6	4520	4525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152206
94	NC_012004	GTC	2	6	4566	4571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152206
95	NC_012004	GAA	2	6	4577	4582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152206
96	NC_012004	AT	3	6	4591	4596	50 %	50 %	0 %	0 %	222152206
97	NC_012004	ATA	2	6	4707	4712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152207
98	NC_012004	ATA	2	6	4758	4763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152207
99	NC_012004	ATA	2	6	4770	4775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152207
100	NC_012004	A	6	6	4804	4809	100 %	0 %	0 %	0 %	222152207
101	NC_012004	AGA	2	6	4828	4833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152207
102	NC_012004	A	7	7	4833	4839	100 %	0 %	0 %	0 %	222152207
103	NC_012004	ATCA	2	8	4868	4875	50 %	25 %	0 %	25 %	222152207
104	NC_012004	A	6	6	4878	4883	100 %	0 %	0 %	0 %	222152207
105	NC_012004	TTA	2	6	4940	4945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152207
106	NC_012004	AT	3	6	4982	4987	50 %	50 %	0 %	0 %	222152207
107	NC_012004	GAT	2	6	4988	4993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152207
108	NC_012004	GGT	2	6	5042	5047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152207
109	NC_012004	ATT	2	6	5066	5071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152207
110	NC_012004	GAC	2	6	5118	5123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152207
111	NC_012004	TTA	2	6	5142	5147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152207
112	NC_012004	GAC	2	6	5177	5182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152207
113	NC_012004	A	6	6	5191	5196	100 %	0 %	0 %	0 %	222152207
114	NC_012004	ATT	3	9	5226	5234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152207
115	NC_012004	A	6	6	5253	5258	100 %	0 %	0 %	0 %	222152207
116	NC_012004	A	6	6	5280	5285	100 %	0 %	0 %	0 %	222152207
117	NC_012004	AGTCAA	2	12	5306	5317	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222152208
118	NC_012004	ATT	2	6	5362	5367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152208
119	NC_012004	GCA	2	6	5405	5410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152208
120	NC_012004	GTA	2	6	5441	5446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152208
121	NC_012004	GAA	2	6	5504	5509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152208
122	NC_012004	T	7	7	5522	5528	0 %	100 %	0 %	0 %	222152208
123	NC_012004	GAT	2	6	5531	5536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152208
124	NC_012004	GCA	2	6	5540	5545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152208
125	NC_012004	ATTT	2	8	5551	5558	25 %	75 %	0 %	0 %	222152208
126	NC_012004	GAT	2	6	5612	5617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152208
127	NC_012004	TAA	2	6	5634	5639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152208
128	NC_012004	TTAT	2	8	5695	5702	25 %	75 %	0 %	0 %	222152208
129	NC_012004	AAC	2	6	5752	5757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152208
130	NC_012004	T	6	6	5867	5872	0 %	100 %	0 %	0 %	222152208
131	NC_012004	AC	3	6	5910	5915	50 %	0 %	0 %	50 %	222152208
132	NC_012004	TGAA	2	8	5934	5941	50 %	25 %	25 %	0 %	222152208
133	NC_012004	TTA	2	6	5988	5993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152208
134	NC_012004	AAT	2	6	6002	6007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152208
135	NC_012004	ATG	2	6	6033	6038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152208
136	NC_012004	A	7	7	6043	6049	100 %	0 %	0 %	0 %	222152208
137	NC_012004	ATT	2	6	6062	6067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152208
138	NC_012004	ATTT	2	8	6109	6116	25 %	75 %	0 %	0 %	222152208
139	NC_012004	ATT	2	6	6118	6123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152208
140	NC_012004	TGA	2	6	6181	6186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152208
141	NC_012004	A	6	6	6192	6197	100 %	0 %	0 %	0 %	222152208
142	NC_012004	GAT	2	6	6248	6253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152208
143	NC_012004	TGA	2	6	6292	6297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152208
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145	NC_012004	TCA	2	6	6385	6390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152208
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147	NC_012004	TGA	2	6	6442	6447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152208
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149	NC_012004	TGA	2	6	6634	6639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152208
150	NC_012004	A	6	6	6639	6644	100 %	0 %	0 %	0 %	222152208
151	NC_012004	A	7	7	6677	6683	100 %	0 %	0 %	0 %	222152208
152	NC_012004	TGT	2	6	6763	6768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152208
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155	NC_012004	A	6	6	6969	6974	100 %	0 %	0 %	0 %	222152208
156	NC_012004	CAAAA	2	10	6975	6984	80 %	0 %	0 %	20 %	222152208
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159	NC_012004	CAA	2	6	7046	7051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152208
160	NC_012004	GAT	3	9	7073	7081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152208
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163	NC_012004	ATC	2	6	7173	7178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152208
164	NC_012004	CTC	2	6	7190	7195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222152208
165	NC_012004	GCA	2	6	7238	7243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152208
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168	NC_012004	AAAG	2	8	7325	7332	75 %	0 %	25 %	0 %	222152208
169	NC_012004	A	6	6	7382	7387	100 %	0 %	0 %	0 %	222152208
170	NC_012004	A	7	7	7414	7420	100 %	0 %	0 %	0 %	222152208
171	NC_012004	ATT	3	9	7433	7441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152208
172	NC_012004	CTT	2	6	7454	7459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152208
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199	NC_012004	A	6	6	8756	8761	100 %	0 %	0 %	0 %	222152208
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267	NC_012004	TTA	2	6	11106	11111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152213
268	NC_012004	TCA	2	6	11149	11154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152213
269	NC_012004	ATG	2	6	11283	11288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152213
270	NC_012004	AAT	2	6	11300	11305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152213
271	NC_012004	AAT	2	6	11321	11326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152213
272	NC_012004	ATTT	2	8	11356	11363	25 %	75 %	0 %	0 %	222152213
273	NC_012004	AAC	2	6	11395	11400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152213
274	NC_012004	GTTG	2	8	11421	11428	0 %	50 %	50 %	0 %	222152213
275	NC_012004	GAA	2	6	11456	11461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152213
276	NC_012004	TAT	2	6	11558	11563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152213
277	NC_012004	TC	3	6	11596	11601	0 %	50 %	0 %	50 %	222152213
278	NC_012004	ATA	2	6	11652	11657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152213
279	NC_012004	ATT	2	6	11664	11669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152213
280	NC_012004	AAC	2	6	11689	11694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152213
281	NC_012004	TGA	2	6	11914	11919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152213
282	NC_012004	TTA	2	6	11921	11926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152213
283	NC_012004	TAT	2	6	11975	11980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152213
284	NC_012004	GAA	2	6	12050	12055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152213
285	NC_012004	AGC	3	9	12073	12081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152213
286	NC_012004	ATG	2	6	12222	12227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152213
287	NC_012004	CATT	2	8	12252	12259	25 %	50 %	0 %	25 %	222152213
288	NC_012004	ATG	2	6	12288	12293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152213
289	NC_012004	TATT	2	8	12316	12323	25 %	75 %	0 %	0 %	222152213
290	NC_012004	ATG	3	9	12334	12342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152213
291	NC_012004	T	7	7	12378	12384	0 %	100 %	0 %	0 %	222152214
292	NC_012004	AT	4	8	12455	12462	50 %	50 %	0 %	0 %	222152214
293	NC_012004	AAC	2	6	12509	12514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152214
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295	NC_012004	A	7	7	12558	12564	100 %	0 %	0 %	0 %	222152214
296	NC_012004	ATA	2	6	12566	12571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152214
297	NC_012004	T	6	6	12640	12645	0 %	100 %	0 %	0 %	222152214
298	NC_012004	AAG	3	9	12659	12667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152214
299	NC_012004	TGA	2	6	12699	12704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152214
300	NC_012004	TGA	2	6	12722	12727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152214
301	NC_012004	TCA	2	6	12800	12805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152214
302	NC_012004	AT	3	6	12842	12847	50 %	50 %	0 %	0 %	222152214
303	NC_012004	TAT	2	6	12880	12885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152214
304	NC_012004	CTTCT	2	10	12950	12959	0 %	60 %	0 %	40 %	222152214
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312	NC_012004	A	6	6	13229	13234	100 %	0 %	0 %	0 %	222152214
313	NC_012004	ATG	2	6	13325	13330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152214
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339	NC_012004	AAT	2	6	14201	14206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152216
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342	NC_012004	TAT	2	6	14380	14385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152216
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351	NC_012004	CAGGTA	2	12	14868	14879	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222152216
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383	NC_012004	AATT	2	8	15990	15997	50 %	50 %	0 %	0 %	222152216
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387	NC_012004	GAA	3	9	16142	16150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152216
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389	NC_012004	A	6	6	16292	16297	100 %	0 %	0 %	0 %	222152217
390	NC_012004	T	7	7	16334	16340	0 %	100 %	0 %	0 %	222152217
391	NC_012004	TGC	2	6	16392	16397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152217
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393	NC_012004	TTTAT	2	10	16464	16473	20 %	80 %	0 %	0 %	222152217
394	NC_012004	TGG	2	6	16503	16508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152217
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397	NC_012004	TGA	2	6	16757	16762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152217
398	NC_012004	TTG	3	9	16832	16840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152217
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400	NC_012004	GGT	2	6	16906	16911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152217
401	NC_012004	T	6	6	16945	16950	0 %	100 %	0 %	0 %	222152217
402	NC_012004	CGA	2	6	16986	16991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152217
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